東海汽船の東京・竹芝客船ターミナル待合室には、特産品販売所・売店・カフェレストランが併設されており、お食事やお買い物に便利です。ショップ竹芝では、パンやおにぎり、お菓子やドリンク類の他、酔い止めやタバコ、アルコール類も販売。レストラン「HARBOR」で和食・洋食・中華を食べられます。ベビールームやATM、コインロッカーも完備。待合所は2か所あるので、ゆっくりお過ごしください。

横浜大さん橋のフロアは、1階・2階・屋上があります。1階は主に駐車場となっており、トイレや喫煙所も完備。2階にチケットカウンターやロビー、ショッピングエリアやレストラン・カフェなど併設しています。タクシー乗り場とバス乗り場も2階にあるので、アクセスしやすいです。

八丈島には、底土港（そこどこう）と八重根港（やえねこう）の2つの港があります。底土港の船客待合所には、受付窓口・休憩スペース・トイレなどを完備。2階には、観光案内所がありますので是非お立ち寄りください。

元町港のターミナルは、西部に位置します。建物内は、広々とした吹き抜けになっており、受付窓口はもちろん、待合室や売店、トイレも完備。食堂があり、ラーメンや蕎麦など食べられます。

新島の西部に位置する新島港には、船客待合所があります。東海汽船の受付窓口やおみやげ屋「いさばや」、新島村観光案内所を併設しているので便利。船客待合所の外に水シャワーや着替えスペース、2階展望デッキがあります。

式根島の北部に位置する「野伏港（のぶしこう）」には、乗り場のすぐ近くに野伏港船客待合所があります。東海汽船の受付窓口や休憩スペース、トイレなど併設。連絡船“にしき”の乗船券は、徒歩数分の所にある式根島観光協会で販売しています。

神津島には、前浜港と多幸湾の2つの入出港地があります。それぞれに東海汽船の受付窓口や待合室を完備。往復で入出港地が変更となる場合がありますので、乗船の際はご確認ください。

三宅島には、三池港・伊ヶ谷港・錆ヶ浜（阿古）港の3つの港があります。それぞれに東海汽船の受付窓口や待合室を完備。往復で入出港地が変更となる場合がありますので、乗船の際はご確認ください。

利島の北部に位置する東海汽船の利島ターミナルは、島内唯一の港湾です。ターミナルの施設には、東海汽船の受付窓口や待合室、トイレがあります。

御蔵島港のターミナルは、御蔵島の北部に位置します。乗り場の近くに、御蔵島港船客待合所があり、東海汽船の受付窓口や休憩スペースが併設されています。

久里浜ターミナルの施設には、横須賀・三崎の名物を楽しめる売店とフードコートがあります。フードコート「コーラル」では、人気のよこすか海軍カレーや三崎まぐろを使ったメニューに日替わりランチなどお食事メニューが充実。売店では、しらす・竹炭のソフトクリームやお土産にピッタリのお菓子や海軍カレーも販売しています。受付窓口・待合室・トイレを完備していますので、ゆっくりお過ごしください。

東海汽船 伊東ターミナルには、受付窓口・待合室・トイレ・自動販売機を完備しています。営業時間は、9：00～16：00。専用の駐車場がないため、周辺の市営なぎさ観光駐車場か、市営大川橋駐車場をご利用ください。ゴールデンウィークや夏休みなど、繁盛期は満車になる可能性がありますので、公共交通機関の利用をおすすめします。

東海汽船 熱海ターミナルには、受付窓口・待合室・トイレ・コインロッカー・自動販売機を完備しています。レストランや売店はありませんので、到着前にお立ち寄りください。